Бухгалтерия ҚарТУ-дың құрылымдық бөлімшесі болып табылады және ректорға тікелей есеп береді.
Есепке алу мынадай негізгі міндеттерді орындайды:
- ҚарТу-дың ресурстарының барлық түрлерінің тиімді және үнемді пайдаланылуын және меншік мүліктің сақталуын ұйымдатырады және бақылауды қамтамасыз етеді;
- бухгалтерлік есептің прогрессивті нысандары мен әдістерін қолдана отырып, құжаттарды басқарудың ұтымды жүйесін қамтамасыз етеді;
- кіріс ақшаны, тауарлық-материалдық қорларды және негізгі құралдарды толық есепке алуды, сондай-ақ олардың қозғалысына байланысты операцияларды есепке алуды уақтылы көрсетуді қамтамасыз етеді;
- күнделікті төлем тізілімдері басшымен келісіледі;
- Қазақстан Республикасының қолданыстағы заңнамасына сәйкес қаржы-шаруашылық қызметі бойынша құжаттардың орындалуын және рәсімделуін қамтамасыз етеді;
- бухгалтерлік есеп және статистикалық есептерге сәйкес университеттің барлық құрылымдық бөлімшелерінің қаржы-шаруашылық қызметін талдау және тікелей жер арқылы тексеру.